Les instances de la fédération répondent à deux principes : celui de l’équilibre entre les différents échelons territoriaux et celui de la parité entre entre élus et techniciens.
Le Conseil d’administration est élu pour 6 ans et se compose de 40 membres :
- 12 représentants du collège des organismes régionaux,
- 12 représentants du collège des organismes départementaux,
- 16 représentants du collège des organismes communaux et Intercommunaux.
La Présidence est assurée pour 2 ans par un Président issu du collège des OT, puis par un Président issu du collège des CRT et enfin par un Président issu du collège des CDT.
Président : Christian Mourisard.
Président délégué : François de Canson
Président délégué : Stéphane Villain
Trois comités stratégiques dédiées à chacun de trois collèges permettent d’élaborer des propositions soumises au Conseil d’administration sur les grands dossiers stratégiques, thématiques, transversaux.